Компании не надо выставлять счета-фактуры со стоимости, отраженной в акте КС-2 и справке КС-3, ежемесячно составляемых подрядчиком, если по условиям договора не предусмотрена поэтапная сдача работ.
Одно из обязательных условий для начисления НДС - приемка-передача результата работ в объеме, который определен в договоре. Заказчик подписал акт КС-2 и форму КС-3. Однако они лишь подтверждают, что стороны согласовали стоимость работ, но не факт их приемки (письмо Минфина России от 14.10.2010 № 03-07-10/13). Ведь условиями договора не предусмотрена поэтапная сдача, нет объемов работ по каждому этапу и сроков их выполнения (п. 18 информационного письма Президиума ВАС РФ от 24.01.2000 № 51). То есть нигде не зафиксировано, что работа или ее отдельный этап закончены и результаты работ переданы заказчику.
Следовательно, формы КС-2 и КС-3 подтверждают, что подрядчик выполнил промежуточные работы, которые заказчик должен оплатить. А этого недостаточно, чтобы начислять НДС со стоимости работ и выставлять счет-фактуру. Так же считают и судьи (постановление ФАС Северо-Западного округа от 26.05.2014 № А56-43881/2013).